La investigación realizada hasta el momento ha llevado al registro de 330 especies diferentes de aves. Esto incluye varios registros primarios en el Departamento de Beni en el norte de Bolivia.
Con la ayuda de voluntarios e investigadores internacionales, Sustainable Bolivia está trabajando para agregar más especies a esta lista; las estimaciones actuales sugieren que hay más de 350 en total. Esta lista incluye la Antpitta enmascarada amenazada (Hylopezus auricularis, una especie endémica rara clasificada como vulnerable por la UICN y registrada en varios lugares distintos dentro de la reserva) y el tucán amenazado de garganta blanca, así como 4 especies de grandes guacamayos Ara.