La existencia de la Reserva también tiene importancia debido a su alta biodiversidad y al hecho de que alberga una serie de especies en peligro de extinción. Una de ellas es la Antpitta enmascarada (Hylopezus auricularis), un ave considerada vulnerable por la UICN, que solo existe en fragmentos de Riberaltas y la Reserva. Además, la Reserva alberga animales como el jaguar (panthera onca), la nutria gigante brasileña (pteronura brasiliensis) y el mono araña peruano (ateles chamek) que se enfrentan a la extinción. La conservación es vital para que estas especies en peligro de extinción sobrevivan.
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Masked Antpitta
(Hylopezus auricularis)
Giant Brazilian Otter
(Pteronura brasiliensis)
Jaguar
(Panthera onca)